Организация Центральной научно-исследовательской лаборатории (ЦНИЛ), главным университетским, общевузовским научно-методическим и экспериментально-клиническим центром, связана с необходимостью решения актуальных медико-биологических проблем медицинской науки и здравоохранения Таджикистана, подготовкой научных кадров, ускоренного развития медицинской науки в её прикладных разделах для более эффективного внедрения результаты экспериментальных исследований в практику здравоохранения.
Идея организации центральных научно-исследовательских лабораторий в СССР принадлежала гениаль¬ному физиологу Ивану Петровичу Павлову, который предлагал сформировать в медицине звено, «соединявшее бы результаты теоретической биологии и экспериментальной медицины с запросами клинической практики».
В 1934 году, решением исполкома г. Сталинабад для строительства медицинского института со своей клиникой было выделено 15 гектаров земли, где было предусмотрено наряду со строительством учебных и клинических корпусов, студенческих общежитий, домов для профессорско-преподавательского состава и строительство вивария (от лат. vivus – живой, называют помещение, где под контролем специалистов лабо¬раторного животноводства осуществляется содержание, а также размножение животных, используемых для экспериментальных (научных) или учебных целей). Однако по разным объективным и субъективным причинам проектирование и строительство ЦНИЛ началось только в 1958 году. В ходе строительства несколько раз меня¬лись назначения и названия лаборатории, первоначально планировалось построить научно-исследовательскую лабораторию медицинского института под названием «виварий», через год на базе строящегося лаборатория было решено создать радиологическую лабораторию, для чего было спроектировано в подвале лаборатории места для установки радиологического оборудования. Позже решили в целях дальнейшего развития и улучше¬ния научно-исследовательской работы в области медицины, что нужно построить совместно с радиологической лабораторией другие лаборатории с виварием. Поэтому до сих пор в документах, хранящихся в различных госу¬дарственных учреждения, ЦНИЛ значится под названием «виварий».
Официально ЦНИЛ ТГМУ имени Абуали ибни Сино была организована в 1961 году в отличие от боль¬шинства ЦНИЛ в СССР, созданных в 1962 году постановлением Совета Министров СССР от 12 августа 1961 года “О мерах по дальнейшему развитию и улучшению научно-исследовательской работы в области медици¬ны”.
ЦНИЛ во время своей деятельности пережила разные исторические периоды расцвета и упадка. Истори¬ческий период с 1992 по 2008 гг. был наиболее тяжелым. В этот период резко сократилось финансирование, со-держание лабораторных животных было крайне затруднительным. За это время покинули ЦНИЛ большинство высококвалифицированных сотрудников, здание и лабораторное оборудование обветшало. Из-за частой смены руководителей университета мало внимания обращалось на ЦНИЛ. С приходом нынешнего руководства во главе с ректором ТГМУ д.м.н., профессором Курбановым У.А. ЦНИЛ переживает свое возрождение. В самый сложный период для ТГМУ (после пожара в главном корпусе) были выделены средства в сумме более 700 тысяч сомони для восстановления ЦНИЛ.
За время существования ЦНИЛ ее руководителями были И. В Мухамеджанов, Н. А. Шелковский, С. Дод¬хоев, Т. М. Тухтаев, Н. Б. Бердиев и А. В. Гулин, М.Д. Вялушкина, М.М.Расули, Р.Мирзошарипов, Х.А. Ганиев, М.А. Хидиров.
При ЦНИЛ были организованы операционный блок, патоморфологическая, гематологическая, био¬химическая и электрофизиологическая лаборатории, а также радиологическое отделение. Тематика научных исследований, состав и штатное расписание лаборатории отражали практическую и теоретическую значимость тех или иных научных направлений в биологии и медицине. В начале деятельности ЦНИЛ при проведение экспериментальных исследований наибольшая загруженность приходилось на операционный блок, затем на сектор морфологии, радиологии, позднее – биохимии и иммунологического сектора.
В 1987 г. на базе ЦНИЛ организовали лабораторию электронной микроскопии, что увеличило удельный вес НИР, требующих изучения ультратонкой структуры органов и тканей, обширнее стала тематика совместных работ, глубже и основательнее морфологические исследования. Научные исследования выполнялись как совместно с другими кафедрами, так и самостоятельно. Тема «Изучение лечебных свойств мумиё» Т.М. Тухтаевым, оказалась очень плодотвор¬ной, накопленный по данной теме материал позволил. в дальнейшем Т. М. Тухтаеву провести основополагаю¬щие обобщения, защитить докторскую диссертацию и выпустить в свет несколько монографий, в том числе «Кровь и мумиё» (совместно с проф. М. X. Бобоходжаевым). Одной из важнейших выполненных научных тем является проблема срочной акклиматизации человека и животных в условиях высокогорья. Вначале исследо¬вания были преимущественно экспериментальными, при этом последовательно велось изучение возрастных, половых и видовых особенностей. В результате было получено большое количество данных, что позволило выявить основные закономерности высокогорного адаптационного синдрома, определить соотношение пози¬тивного и негативного влияния на организм гипоксической гипоксии и других факторов горного климата. Ито¬гом явилась защита докторской диссертации Н. Б. Бердиевым (1981). Одновременно выполнялись кандидатские диссертации С. Г. Мухамедовой, Н. В. Анисимовой (в 1988 г. работы были защищены и утверждены), С. В. Беляевой, Э. Н. Зейналиевой, О. И. Бобоходжаевым, Р. С. Галиевым. Кроме мумиё изучались физиологическое и патологическое состояния человека и животных в условиях высокогорья, закономерности морфогенеза, реге-нерации и эндокринной регуляции процессов в организме. Был обнаружен оздоравливающий эффект факторов высокогорья на высоте от 2000 до 3500 м над ур. моря. Он выразился в повышении уровня ряда окислительно-восстановительных, пластических и иммунобиологических показателей, в усилении естественной резистент¬ности организма при ступенчатой акклиматизации, что позволило от эксперимента перейти к планомерному изучению благоприятного влияния гор на больной организм и к лечению больных с бронхиальной астмой в пос. Зидды (2000 м) и в высокогорном стационаре института, расположенном на перевале Анзоб Гиссарского хребта (3375 м над ур. моря). Развитие биохимического направления в лаборатории в 70-х годах связано с именем стар¬шего научного сотрудника, кандидата меднаук И. И. Агабековой. Особенно важное значение в это время приоб¬рело, изучение ферментативной активности на субклеточном уровне при, акклиматизации к высокогорью и при ряде заболеваний человека. Создание сектора иммунологии (старший научный сотрудник, кандидат биологи¬ческих наук Л. В. Адамчук, 1979) означало активизацию усилий в изучении естественных защитных сил орга¬низма животных и человека. С помощью старшего научного сотрудника, кандидата меднаук М. Д. Вялушкиной в дополнение имеющимся были налажены многочисленные современные иммунологические методы анализа, развернуты цитохимические и аллергологические исследования в лаборатории. Отделение радиобиологии было открыто вместе с ЦНИЛ; шел активный процесс изучения механизма радиационного воздействия на организм не только из-за возможной угрозы атомного поражения, но и благодаря начавшемуся широкому использованию меченых атомов в медицине и народном хозяйстве.
Сотрудники лаборатории гематологии в короткий срок овладели не только рутинными методами ана¬лиза крови, но и достаточно серьезно изучали изменения в лимфоидной ткани костного мозга при различных заболеваниях и воздействиях (Т. М. Тухтаев, Н. В. Глыбина, С. В. Кудринская, Т. В. Колодкина). Большое значение для определения научного направления лаборатории, конкретных целей и задач имели межинститут¬ские связи и работы, выполняемые, на основе творческого содружества, особенно, с Ленинградским педиа¬трическим медицинским институтом, Институтом клинической иммунологии Сибирского отделения АМН СССР, Институтом физики АН Белоруссии, Институтом иммунологии МЗ СССР, НИИ химии АН Таджикской ССР. Исследования позволили провести серию перспективных в научном и практическом плане эксперимен¬тов, выполнить диссертационные работы, участвовать в работе ряда конференций по актуальным вопросам биологии и медицины, обогатиться, опытом разных научных школ и направлений, значительно повысить ме¬тодический уровень.
За время существования ЦНИЛ на ее базе было выполнено и защищено 36 докторских и 112 кан¬дидатских диссертаций, опубликовано более 600 совместных работ, получено 18 авторских свидетельств на изобретение.
В настоящее время, функционируют биохимическая, клиническая, морфологическая, молекулярно-генетическая лаборатории, лаборатория эксперимен¬тальной фармакологии и экспериментальной хирургии. Экспе-риментальные оперативные вмешательства проводятся в 2-х операционных блоках. Лабораторные животные выращиваются виварием ЦНИЛа.
Научные направления ЦНИЛ разнообразны и обусловлены приоритетными направлениями научных ис¬следований университета, а также целями и задачами научных тем кафедр, на базе которых проводятся научные изыскания.