В середине 20 века в республике возросла потребность в подготовке врачей-педиатров. Из-за отсутствия педиатрического факультета в институте стали готовить врачей-педиатров из числа студентов лечебного факультета путём организации субординатуры при кафедре детских болезней, которая была создана в 1941 году.

В 1958/59 учебном году был впервые открыт педиатрический факультет, деканом которого являлся доцент А.М. Пилосов, внесший большой вклад в организацию и развитие факультета. Для ускоренной подготовки врачей-педиатров были организованы 2-й и 3-й курсы педиатрического факультета из числа самых лучших студентов лечебного факультета. В этом же году был проведен первый самостоятельный набор из 76 студентов. Организована первая кафедра педиатрического факультета, которой заведовала Г.Е. Лёвина. Позже, в 1964 году были организованы ещё две кафедры внутренних болезней (зав. кафедрой – профессор М.Х. Бобоходжаев) и детской хирургии (зав. кафедрой – профессор А.Т. Пулатов).

Деканами педиатрического факультета работали такие известные не только в нашей республике, но и за рубежом медицинские работники, как доцент Н.Х. Хошимов (1960-1965), профессор Ф.А. Абдурахмонов (1965-1969), профессор Ю.И. Датхаев (1969-1975), доцент И.Ю. Юлдошев (1975-1981), доцент М.К. Каримов (1981-1992), профессор Н.Ф. Файзуллоев (1993-1996). С 1996 года в связи с объединением лечебного и педиатрического факультетов деканом являлась доцент Р.Ш. Ашурова (1996-2000), а затем профессор Э.С. Шерматов (2004-2005), доцент Л.А. Бабаева (2005-2009).

В 2014-2015 учебном году вновь возобновили педиатрический факультет, и состоялся первый набор студентов на педиатрический факультет, деканом которого был профессор М.С. Табаров (2014-2020).

В настоящее время факультет возглавляет д.м.н. Усманова Г.М. (с февраля 2020г.).

За время существования педиатрического факультета из стен нашего университета было выпушено более 6000 врачей-педиатров.

Помним и чтим учёных, которые всю свою жизнь посвятили развитию педиатрии в нашем университете – это М.М. Якубова, С.М. Кабулова, А.М. Миракилова, А.Т. Пулатов, Б.Я. Вялушкин, З.Я. Абдуллоходжаев, С.Б. Бобоев, Азизов А.А., Аминов Х.Дж., которые на протяжение долгих лет заведовали кафедрами педиатрического профиля.

В настоящее время на кафедрах педиатрического профиля работают ученые – профессора и доценты, внёсшие неоценимый вклад в организацию и развитие педиатрической службы республики, такие, как: Якубова З.Х., Исмаилов К.И., Умарова З.К., Н.Ф. Файзуллоев, Азизов А.А., Бабаева Л.А., Мамаджанова Г.С., Ходжаева Н.М., Саидмурадова Г.М., Давлатова С.Н. Наши ученые до сих пор стоят на страже защиты нашего будущего – наших детей.

Богатый врачебный опыт плеяды наших учёных позволит подготовить специалиста – врача-педиатра, обладающего системой универсальных и профессиональных компетенций, необходимых для оказания специализированной педиатрической помощи детскому населению, способного и готового к самостоятельной профессиональной деятельности, постоянному самосовершенствованию и интеграции научных знаний в соответствии с требованиями мирового сообщества.

Будущее наших детей должно быть в надёжных руках.

В состав факультета входят 15 кафедр, в числе которых 5 профильных кафедр. Профессорско-преподавательский состав педиатрического факультета составляет 236 человек, в том числе 24 (10,2%) доктора наук и 72 (30,5%) кандидатов наук. Из них 22 (9,3%) имеют звание профессора и 39 (16,5%) звание доцента. Количество ассистентов составляет 128 человека, внешних преподавателей-совместителей - 35.